众所周知，蛋白质是生命的物质基础，也是基因功能的执行者。而许多蛋白质前体是没有活性的，需要经过翻译后修饰（PTM）等复杂过程才具有生理功能，因此PTM已成为生物学研究中的重要内容。核蛋白棕榈酰化呈现是作用最普遍的脂酰化修饰，影响约20%的蛋白组。然而由于一般的棕榈酰蛋白含量低，高特异性富集棕榈酰修饰困难等技术挑战，极大地阻碍了该领域的进一步研究。拜谱生物采用ABE结合质谱高通量方法，以无偏倚地看见全部整个蛋白酶质组中的棕榈酰化，为各位科研工作者的研究带来“独特视角”，助力提升课题及文章水平。那么棕榈酰化参与调控哪些疾病过程的蛋白功能变化？该修饰有哪些重要的科研意义？以及该产品的特色优势，今天将为大家一一揭秘。

01 、可逆反应的S-棕榈酰化表达

大部分而言的棕榈酰化（S-palmitoylation或S-acylation）为S-棕榈酰化，包括棕榈酸和血清质半胱氨酸的巯基结合实际，成型不稳定性的硫酯键，本身棕榈酰化兼具可逆性性，由棕榈酰基更换酶（PAT）和去棕榈酰化酶（APT）介导控制，中间DHHC是一种个固执的非常重要的PAT皇室家族。

图1 由DHHC和APT介导的不可逆转S-棕榈酰化

（商品图片再插入图片，来于：Thomas Lanyon-Hogg, et al., Trends Biochem Sci, 2017）

02 、棕榈酰化很广组织女性生理阶段

最近几天的研究周到列举了棕榈酰化蛋清，涉及到从卡子和4g无线手机信号灯蛋清到化合物区域和感觉，某些棕榈酰化蛋清普遍陆续参与免疫抗体抗体检测反馈、肺癌、分泌、转录、中枢神经菌物学和4g无线手机信号灯等生活方面整个过程，通常是在突触传达、遗传免疫抗体抗体检测反馈、GPCR和酪氨酸激酶4g无线手机信号灯和转录要素功用等区域的生活方面干扰。棕榈酰化呈现能够自动调节靶标蛋清的精确定位和功用，在稳定受损细胞恒定中极具至关为重要的帮助。举例说明，免疫抗体抗体检测分泌糖蛋清CD36，有一种清道夫感觉和肌肉含量酸易位酶，中止CD36棕榈酰化将转换肌肉含量酸摄食、JNK/NF-κΒ4g无线手机信号灯，恐怕AMPK系统激活的肌肉含量酸β-被氧化，其与其白酒性肌肉含量肝病有关的信息。

图2 棕榈酰化血清基本广泛应用的生理上引响

（图源：Saara-Anne Azizi, et al., Acc Chem Res, 2019）

03 、棕榈酰化与多类问题相关

血清质棕榈酰化在疾患中的用处还可以先从酶的方是探究，棕榈酰基转到酶DHHCs在大部分菌物的时候中的用处就建立，其介导的棕榈酰化絮乱会以至于一编影响，一些方面的问题影响以结构特喜欢的人的途径形成，如ZDHHC3、7、9、13和15体验性运动神经疾患的发作策略；ZDHHC7和20与肺癌有关的信息；ZDHHC1、5、11、13、21体验性排泄性疾患；ZDHHC2、3、6、7、8、15、19和20体验性感然性疾患。

图3 棕榈酰基转变酶ZDHHCs组织开展特喜欢的人的干预人工各种传染性疾病

（图源：Lu Hu, et al., RSC Chem Biol, 2021）

1) 肠癌

一点核心的癌症复发复发晚期相应的蛋清质是被棕榈酰化遮盖的。一款金典的例证是RAS网络家族的小GTPases，HRAS、NRAS和KRAS-4A总会时有发生可逆转地S-棕榈酰化，这对于那些固定质膜并就能图片转换内部至关核心，取决了车辆运输和无线信号功能。另其中一个各方面，从更密切的方向角看下，Bailey醉鬼将比较近299个已认可的癌症复发复发晚期驱使指数与SwissPalm（一款蛋清质棕榈酰化数据资料库）配比，結果有76个(26%)的简码蛋清质质是棕榈酰化的，发现了一些遮盖与癌症复发复发晚期的相应的性。

图4 更多癌症晚期驱动软件指数公式几乎都是棕榈酰化的

（图源：Pin-Joe Ko & Scott J Dixon, EMBO Rep, 2018）

上海交大许杰团队此前报道发现PD-L1棕榈酰化的存在，并对其进行了深入的功能和机制探究，这种修饰通过阻断PD-L1的泛素化来稳定PD-L1，从而抑制溶酶体对PD-L1的降解。并设计了一种竞争性的PD-L1棕榈酰化抑制剂，可降低肿瘤细胞中PD-L1的表达，以增强T细胞对肿瘤的免疫。这一研究为克服PD-L1介导的癌症免疫逃逸提供了新的策略。2022年4月，瑞士日内瓦大学的科学家Gonzalo P Solis等人也在《Nat Commun》中表示，球蛋白棕榈酰化可能变为抗肿瘤药物治疗的新靶点，相关结果在“Local and substrate-specific S-palmitoylation determines subcellular localization of Gαo”一文中。

图5 探究式PD-L1棕榈酰化的自我调节共识机制将能控制肝癌根治

（图源：Han Yao, et al., Nat Biomed Eng, 2019）

2) 传染性性皮肤疾病，以新冠试对

新冠电脑病原体是什么水粒子被第一层脂质双大分子层围住，但其中包含SARS-CoV-2 S等膜核蛋白，SARS-CoV-2 S复杂靶神经细胞搭配和电脑病原体是什么融和。在电脑病原体是什么染病前几天，SARS-CoV-2 S形成广泛棕榈酰化遮盖，尤其是是SARS-CoV-2 S先内质网和高尔基体中10个胞质半胱氨酸上形成怏速棕榈酰化。进一步的一个脚印研发表达，SARS-CoV-2 S棕榈酰化在电脑病原体是什么包膜内造成饱含甘油三酯的脂质机构域，棕榈酰化和脂质生物技术学合出手段可以淡化新冠电脑病原体是什么的交叉感染性。该研发看向棕榈酰化遮盖酶和脂质生物技术学合出酶是新颖抗电脑病原体是什么疗法靶点。 另外，SARS-CoV-2 S的棕榈酰化对于那些合胞体型成和SARS-CoV-2假病原体粉末到至关更重要。ZDHHC2、ZDHHC3、ZDHHC4、ZDHHC5、ZDHHC8、ZDHHC9、ZDHHC11、ZDFHC14、ZDHHC16、ZDHHC19和ZDHHC20的导致过度表答带动了S的棕榈酰化，一些ZDHHCs被认定为与SARS-CoV-2 S涉及。

图6 S-棕榈酰化有效控制SARS-CoV-2膜脂组织化，强化交叉感染性

（图源：Francisco S Mesquita, et al., Dev Cell, 2021）

2021年，苏州大学生物医学研究院周芳芳教授课题组在Advanced Materials上发表了题为“Engineering Extracellular Vesicles Enriched with Palmitoylated ACE2 as COVID-19 Therapy”的研究论文，该研究发现血管紧张素转化酶2（ACE2，一种直接与SARS-CoV-2 S相互作用的关键受体）存在棕榈酰化修饰，且棕榈酰化对ACE2的膜靶向和胞外囊泡分泌至关重要。该研究设计了富含棕榈酰化ACE2的胞外囊泡，利用该囊泡饱和SARS-CoV-2 S作为病毒陷阱，抑制SARS-CoV-2的感染。

图7 设计方案食含棕榈酰化ACE2的胞外囊泡主要用于诊治新冠肺气肿

（图源：Feng Xie, et al., Adv Mater, 2021）

3) 排泄性慢性病，以糖尿病的风险概述

2023年1月11日，美国华盛顿大学Clay F. Semenkovich团队在Cell Metabolism上发表了题为“Palmitoylation couples insulin hypersecretion with β cell failure in diabetes”的文章。该研究发现人体组织胰岛素的过量生产与棕榈酰化过程相关，这种棕榈酰化作用可被酰基蛋白硫酯酶1（APT1）逆转。通过棕榈酰化蛋白质组学发现，Scamp1是APT1的底物，定位于胰岛素分泌颗粒，敲低Scamp1会引起胰岛素分泌过多，促进β细胞衰竭，提示棕榈酰化参与糖尿病的发病过程。该研究不仅有助于理解糖尿病发病机制，同时为高风险人群提供了预防或延缓糖尿病的潜在靶点。

图8 棕榈酰化使糖尿病朋友朋友胰岛素外分泌亢进与β血细胞衰退

（图源：Guifang Dong, et al., Cell Metab, 2023）

4) 周围神经类皮肤疾病

棕榈酰化在精神末梢元4g移动讯号渠道主装中的反应已被深入研发研发，D2多巴胺多巴胺受体(D2R)改善抑郁情绪和看法，与精神抖擞瓦解症和治疗帕金森业内，Cys443是质膜继承营养的棕榈酰化位点，研发发现了D2R与DHHC3、DHHC4和DHHC8相护反应。ZDHHC9已被确认为精神末梢工作的要点改善指数公式，海马培养出来物中由于缺乏ZDHHC9诱发树突结构特征减短和克制性突触减弱。ZDHHC9可以完成介导Ras棕榈酰化修改密码ERK径路。棕榈酰化Ras位置定位于质膜，修改密码中下游MAPK4g移动讯号径路，诱发树突生张，ZDHHC9在精神末梢互联网中失衡亢奋性和克制性4g移动讯号。ZDHHC9工作缺乏转变诱发棕榈酰化程度问题，将涉及到精神末梢涉及到妇科患病，如X茶叶连锁智能问题(XLID)和是癫痫症。ZDHHC13已被證明在维护顾虑涉及到情况、行动工作和脑细胞生态学能学管理方面切实发挥要点反应。ZDHHC13的工作缺乏转变诱发其中包括Drp1少部分的大量底物的低棕榈酰化程度。然而，ZDHHC13工作问题也与代谢率和退行性妇科患病业内。

图9 DHHC介导底物棕榈酰化掩盖，调空生理学方面的问题特点

比如心室复氧（DHHC5）中的角色；周围神经功效，如突触可弹塑性（DHHC5）；有免疫检测对答（DHHC21）；耐力心里障碍（DHHC9）；结十二指肠癌、肝癌癌细胞癌和非小癌癌细胞1.肺癌（NSCLC；DHHC2）；和癌症（DHHC9） （图源：Thomas Lanyon-Hogg, et al., Trends Biochem Sci, 2017）

04 、拜谱独代装饰——棕榈酰化装饰蛋白质组

棕榈酰化表达淀粉酶组是对生物样品中的棕榈酰化位点/肽段进行全局无偏的定性定量分析，主要用于探求据此问题想关的生态学学制度和靶标找到。拜谱生物作为国内首家提供该服务的公司，可以助力科研工作者开展多个领域的研究，以下是我公司该产品的特点：

1) ABE方式

棕榈酰化就算在1979年强调并于1980年在组织细胞提升中得见查验，但检侧淀粉酶质棕榈酰化的高技术终极挑战从而地阻拦了该的领域行业的进这一步学习，是直到21世经，根据酰基-动物素交换法（ABE）的产生，对该的领域行业功能键和调空的看待才可获得迅速的进步。ABE巧用硫酯键的忽高忽低判定将棕榈酰化转化率为动物素基团，可以半胱氨酸活性聊天的方式英文洞察分析底物棕榈酰化。

2) 产品相关经验多种，棕榈酰化位点检验量打破2万

拜谱生物棕榈酰化PTM平台拥有丰富的服务经验：在植物结构和内部的项目中具有稳定优势，目前为多家高校和医院单位提供了细胞、卵巢、肿瘤、皮肤、乳腺、肝脏等样品的数据检测与分析服务，位点鉴定量最高可达2w+水平；在树木果肉和花朵图片的研究中也呈现出优秀的数据，如蕃茄花的位点鉴定量高达1w+。在病原体真菌孢子、病害害的研究中也不断积累经验，目前承接过的样品类型有稻瘟菌菌丝、稻曲菌等。

图10 拜谱动物棕榈酰化体现蛋清组的局部业务丰富经验

3) 靶标遇到与验正“一趟式”分析一下

在疾病标志物检测、药物开发、生物信号通路研究中，我们推荐组合方案：棕榈酰化修饰语核蛋白组+棕榈酰化PRM检验，一站式解决靶标发现与验证。

4) 方式雄厚的半胱氨酸突显组

蛋白质中的半胱氨酸是一个极其活跃的残基，可以进行多种翻译后修饰，因此除棕榈酰化掩盖淀粉酶组检测以外，我们还可提供亚硝基化、谷胱甘肽化或者Total 氧化的备份绘制核蛋白组分析，以及次磺酸化和巯基化正在开发测试中。

5) 送样意见与建议

参阅专著：

[1] Lanyon-Hogg T, Faronato M, Serwa RA, Tate EW. Dynamic Protein Acylation: New Substrates, Mechanisms, and Drug Targets. Trends Biochem Sci. 2017;42(7):566-581. doi:10.1016/j.tibs.2017.04.004

[2] Azizi SA, Kathayat RS, Dickinson BC. Activity-Based Sensing of S-Depalmitoylases: Chemical Technologies and Biological Discovery. Acc Chem Res. 2019;52(11):3029-3038. doi:10.1021/acs.accounts.9b00354

[3] Hu L, Tao Z, Wu X. Insights into auto-S-fatty acylation: targets, druggability, and inhibitors. RSC Chem Biol. 2021;2(6):1567-1579. Published 2021 Aug 25. doi:10.1039/d1cb00115a

[4] Ko PJ, Dixon SJ. Protein palmitoylation and cancer. EMBO Rep. 2018;19(10):e46666. doi:10.15252/embr.201846666

[5] Yao H, Lan J, Li C, et al. Inhibiting PD-L1 palmitoylation enhances T-cell immune responses against tumours [published correction appears in Nat Biomed Eng. 2019 May;3(5):414]. Nat Biomed Eng. 2019;3(4):306-317. doi:10.1038/s41551-019-0375-6

[6] Mesquita FS, Abrami L, Sergeeva O, et al. S-acylation controls SARS-CoV-2 membrane lipid organization and enhances infectivity. Dev Cell. 2021;56(20):2790-2807.e8. doi:10.1016/j.devcel.2021.09.016

[7] Xie F, Su P, Pan T, et al. Engineering Extracellular Vesicles Enriched with Palmitoylated ACE2 as COVID-19 Therapy. Adv Mater. 2021;33(49):e2103471. doi:10.1002/adma.202103471

[8] Dong G, Adak S, Spyropoulos G, et al. Palmitoylation couples insulin hypersecretion with β cell failure in diabetes. Cell Metab. 2023;S1550-4131(22)00549-6. doi:10.1016/j.cmet.2022.12.012