
近日,上海医科二本大学首个附设卫生院王学浩院士评选微商团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗能源分泌检测分析服务。
英语翻译标题格式:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
汉语小标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
用户企事业单位:南京医科大学
调查建材:细胞
拜谱提供数据贴心服务:转录组测序+蛋清互作组+靶向药物精力排泄组
技術风格:
科研最终
01、YBX1被认定为HCC中糖酵解的关键性DNA
本研究方案采集程序HCC肺部肿癌样版(n=7)的单神经受损神经元RNA测序数值概述集做概述,感觉糖酵解活力基本集合在肺部肿癌神经受损神经元中,hdWGCNA概述自动识别出9个遗传基因引擎(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的发展概述确认YBX1为单独的发展危害性要素(图1H)。进步骤融合IHC、WB实验所和肺部肿癌企业安排与相邻非肺部肿癌企业安排的余地转录组学数值概述集声明YBX1是肝神经受损神经元癌的治疗的因素靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为调试HCC細胞糖酵解的重要要素
02、YBX1提高HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗消耗的能量消化吸收组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1根据并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,淀粉酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1融合并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷酸性反应,进而提高其核转位
进一部查测YBX1的O-GlcNAc糖基化会不会的影响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT减弱剂OSMI-1办理,YBX1血清品质取得较低,YBX1磷硝化作用取得提高(图4A-C)。IP实验英文体现 ,在相似的Flag-YBX1底物品质下,YBX1-WT的磷硝化作用品质取得要高于YBX1-T57A,取决于磷硝化作用的多往往仅是这是由于更强的YBX1血清表述(图4D)。拆分了核和质酚类化合物察觉到TMG办理的HCC神经元中YBX1核表述的增高(图4E-F),进一部察觉到YBX1磷硝化作用的最为关键的的调节指数是AKT(图4G-I)。这类察觉到讲求O-GlcNAc糖基化能够增进其磷硝化作用来增加YBX1血清维持性并增进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 突显有益于于其切实一个脚印会发生磷酸性反应突显并也能促使其核转位
05、YBX1有利于促进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推进PKM2转录
06、YBX1 就能挺高组核蛋白乳碱化装饰标准
探究知道YBX1敲低同质性降底蛋清质乳酸性反应,特别是在是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解抑止剂2-DG的科学试验印证了糖酵解与组蛋清乳酸性反应的可以微信关联,抑止糖酵解可同质性降底H3K18la横向(图6D)。PKM2过体现可逆性转YBX1敲低形成的H3K18la的降低,到外源乳酸处置不仅能增加H3K18la,还触发YBX1体现调整,提示卡有着单向上报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR印证,H3K18la凭借聚集于YBX1启用子可以增强学习其转录,该流程受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并知道P300 调整是YBX1增强学习H3K18乳酰化做用的体系(图6K-L)。
图6.YBX1提升H3K18乳酸性反应表达标准
论文总结ppt
在一项项探讨中有关报道了YBX1在HCC中高展现,还有就是与糖酵解谜切关联。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,然后动态平衡淀粉酶质并增添其展现。这些绘制还加速YBX1在T57处的磷硝化作用,加速其核易位。故此,一项整个过程激发了糖酵解关联DNA遗传的转录并刺激到乳酸的产生。除此之外,YBX1激发P300的转录,于是驱动器组淀粉酶的乳硝化作用,格外是H3K18la,H3K18乳硝化作用单向宏观调控YBX1DNA遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正负极馈环机制化图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向治疗能量转换新陈代谢组技术服务,拜谱微生物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻译工作后绘制组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参照文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.